電影: Game Freak

收集到關都八個道館徽章的小智與他的同伴，某日，和海盜風格的訓練家(台譯：美國男)戰鬥完後，忽然收到快龍送來的信，內容說是要邀請他們和「全世界最強的訓練家」會面，地點是新島的神奇寶貝城，他們就毫不遲疑的前往。然而這其實是被人類以複製方式所創造出的神奇寶貝—超夢為了報復，所設下的陷阱。而這時，在亞馬遜叢林的深處，夢幻也感受到超夢的存在而甦醒，一場「本尊」和「分身」間的戰爭即將展開.....。...

在橘子群島一帶旅行的小智等人，某日在乘船時意外被暴風雨吹至當中的一個島嶼-亞西亞島，當地適逢慶典，他們結識少女芙蘆拉等居民，並得知流傳島上的古老傳說。 就在同時，貪婪的收藏家吉爾露太，為了滿足自己的收藏慾望，捕捉了傳說中神聖不可侵犯的的火焰鳥與閃電鳥，甚至想進一步捕捉急凍鳥，以引出傳說中的海之神-洛奇亞，致使傳說成真，各處氣候變異、關都，城都地區步向毀滅，小智決定挺身而出前往化解危機.......

綠色草原，是個能夠使人和神奇寶貝都心境安寧的地方，在這裡住著秀力博士和他的女兒小美，有一天，秀力博士在遺跡裡研究神秘神奇寶貝-未知圖騰的時候，不小心被吸進異次元內，小美十分思念父親，沒想到竟因此喚醒了未知圖騰。未知圖騰將小美的心靈以結晶化呈現，最後更創造出小美最喜歡的傳說神奇寶貝-炎帝，小美因此誤以為爸爸變成炎帝的模樣回來了，炎帝為了實現小美的心願，並充當他的爸爸。小智的媽媽和秀力博士是舊識，因為擔心小美而趕來，在這碰到剛結束對戰來到這裡休息的小智他們。沒想到炎帝卻從結晶塔中出現，將小智的媽媽暫...

寶可夢廣場是爲寶可夢而準備的遊戲場所。皮卡丘、波克比、傑尼龜，還有一些大家熟悉的寶可夢們，都在那裏快樂遊玩。但，皮卡丘與傑尼龜等同伴因爲小事跟別的寶可夢吵起來，吵醒了在睡覺的波克比，也引起了一場意外.........

小智一行人在大樹下打盹時，頑皮的波克比卻沒有和大夥一起入睡而跑出去玩耍，為了尋找走失的波克比，皮卡丘和所有的寶可夢們一起來到一個巨大的樹林叢中，在裡面遇見了電擊怪，還認識了一大堆的新朋友，波克比好像和一群蛋蛋玩的不亦樂乎，就在大家玩得很快樂的時候，突如其來的暴風雨，卻讓大夥陷入困境，寶可夢們要如何度過呢？...

小智一行人來到一座大城市，並把皮卡丘留在市中心的一個高樓空中花園玩，約定傍晚來迎接。此時皮卡丘不經意地朝旁邊的大樓望過去，看到了一對可愛的皮丘兄弟。皮丘兄是頭上有一撮毛的沈穩派，但相較之下皮丘弟卻喜歡惡作劇。皮丘弟不聽老哥的勸阻而亂跑，突然間就從樓上掉下去了！皮卡丘趕緊飛奔過去，可是往下面一看才發現所站的地方太高了，一不小心掉下去的話可就完了！沒想到就在此時居然有一群黑暗鴉攻擊皮卡丘… 之後在經歷被戴魯比追趕、把輪胎祕密基地搞壞並重建的過程中，時間一分一秒的流逝。眼看傍晚就要到了，皮卡丘能即時...

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一共收錄2則短篇故事 《信使鳥的禮物》 皮卡丘和寶可夢們正打著雪仗鬧著玩，沒想到那雪球居然不偏不倚地擊中了恰巧飛過的信使鳥，一大堆的禮物就那麼嘩啦嘩啦地從天空掉了下來！大家夥為了要幫助看來相當困擾的信使鳥，便決定同心協力幫助信使鳥找尋散落的禮物… 《白色故事》 白色的卡比獸出現啦！不、不會吧?!該不會是皮卡丘和寶可夢們所做的那個卡比獸雪人動了起來了吧？！ 皮卡丘和寶可夢們跟著白色卡比獸走著走著走近了懸崖邊，不料就在這個時候，懸崖突然崩塌了，這千鈞一髮之際……...